常见不良反应为哮鸣、咯血、咳嗽、胸闷、呼吸困难、发声困难、口咽疼痛、呼吸急促、咽干、头晕。

妥布霉素通过抑制肾脏细胞中的蛋白质合成，可能干扰肾脏正常的生理功能，导致急性或慢性肾损伤，严重时可引起急性肾衰竭。

拧开妥布霉素吸入溶液的瓶盖，将药液全部挤入雾化杯中。注意不要在雾化器中稀释或与其他药物混合。开启雾化器，将雾化器喷嘴放入口中，或通过鼻夹辅助通过嘴巴呼吸。正常呼吸，直至雾化完全（没有雾气产生），雾化时间约10~15分钟。

如漏用一次药物，则应在距下次计划用药时间至少6小时前尽快补用。如距下次计划用药时间不足6小时，则无需补用，下次仍按原计划时间及剂量用药。