奈拉宾最常见的副作用包括疲劳、胃肠道疾病、血液学疾病、呼吸系统疾病、神经系统疾病以及发热。

单药治疗

成人患者：奈拉宾治疗成人T细胞急性淋巴细胞白血病（T-ALL）/T细胞淋巴母细胞淋巴瘤（T-LBL）试验和成人慢性淋巴细胞白血病试验显示，成年人最常见的不良反应是疲劳；胃肠道疾病（恶心、腹泻、呕吐和便秘）；血液学疾病（贫血、中性粒细胞减少和血小板减少）；呼吸系统疾病（咳嗽和呼吸困难）；神经系统疾病（嗜睡和头晕）；还有发热。

其他不良反应：4%的成年患者出现视力模糊。

神经系统不良反应：在I期和II期试验中，76%的成年患者出现神经系统不良反应。

成年患者的大多数神经系统不良反应被评定为1级或2级。成人患者的其他3级不良反应为失语症、抽搐、偏瘫和意识丧失，各报告1例（1%）。其他4级不良反应为脑出血、昏迷、颅内出血、白质脑病和代谢性脑病，每种反应报告1例（1%）。

联合多药化疗治疗

在一项随机临床试验中，研究了奈拉宾与多药化疗联合使用的安全性。奈拉宾组有一例致命的神经系统不良反应。与对照组相比，奈拉宾治疗组中以下3、4级不良反应的发生率较高，其中包括转氨酶异常、运动和感觉神经病变、恶心和呕吐、脱水。任何级别癫痫发作的发生率为3%（411例中有14例）。在接受奈拉宾治疗的患者中，有2%（411例中有7例）诊断为横纹肌溶解症，通常在奈拉宾治疗的巩固期的第一个疗程后发生。